原标题:上海长征医院邵成浩团队:基于芯片及综合生物信息学分析胰腺癌中潜在关键基因及长链非编码RNA AME作者面对面
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胰腺癌是预后最差的消化道恶性肿瘤之一,患者病死率接近100%,5年生存率不到9%。其恶性程度高,早期症状不典型,晚期病程进展快,临床上没有敏感的早期诊断指标或有效的治疗靶点,近20年来胰腺癌患者总体疗效一直没有得到显著提高。因此进一步探讨胰腺癌发生发展机制是提高其预后的当务之急。
本研究通过lncRNA-mRNA生物芯片筛选出了胰腺癌中差异表达的基因及长链非编码RNA。并利用GO分析、KEGG分析等对其进行了生信富集,获得了其差异表达谱的生物功能通路预测,提示这些转录本通过不同的信号通路与胰腺癌的恶性表型及发生发展相关。随后,我们利用Oncomine、Enrichr、GEPIA等数据库,结合芯片数据构建胰腺癌及癌旁组织的lncRNA-mRNA共表达网络,从中进一步出分析筛选出5个潜在热点基因(SFTA2、COL17A1、HOXA13、RTN1、与CHRAC1)和16个相关热点长链非编码RNA(AL109748.6、AC125792.1、CTD-2292M14.1、AK027298、AK094441、BC084573、RP11-288L9.1、AC012005.5、NR_002827、NR_024058、NR_024427、AK056486、RP11-312H15.3、AC006427.3、BC035067与CTD-2066L21.3)。它们将有望成为今后胰腺癌早期诊断的生物标志物或潜在治疗靶点,当然对于这些潜在靶点还需要更多进一步的深入研究。(论著中文信息由第一作者整理提供,欲览英文原文请扫描下方二维码)
梁兴,主治医师,讲师。毕业于上海第二军医大学,先后工作于上海长海医院及上海长征医院。师从全国胰腺肝胆外科著名专家邵成浩教授。主攻胰腺肝胆外科相关疾病的临床诊疗及基础分子生物学研究,以“胰腺癌的新辅助治疗”与“胰腺癌表观遗传调控”为特长方向。以第一作者或共一作者发表SCI论著8篇,国内核心中华期刊论著4篇。曾在第十九届国际胰腺病学会年会(IAP)、第九届中国抗癌协会胰腺癌专业委员会年会(PCCA)中,获得青年医师二等奖(2015 PCCA & IAP Award Second Prize),并于大会上演讲汇报。
邵成浩,主任医师,教授,博士生导师,现任海军军医大学第二附属医院,即上海长征医院胰胆外科主任,兼胰胆外科学科带头人。目前担任中华医学会外科学分会胰腺外科学组委员、中国研究型医院协会胰腺病专业委员会副主任委员、中国抗癌协会胰腺癌专业委员会副主任委员、中国医师协会外科分会胆道外科医师专业委员会常务委员、中国医师协会外科分会机器人外科医师委员会委员、上海市医学会外科分会委员、上海市医学会普通外科专业委员会委员、上海市医学会普外科专业委员会胆道外科学组副组长、中国抗癌协会胰腺癌专业委员会神经内分泌肿瘤学组组长等多个学术任职。
胰腺外科领域资深专家,在胰腺癌、急性重症胰腺炎、慢性胰腺炎、胃肠胰神经内分泌肿瘤、胆道肿瘤等疾病的治疗上积累了丰富的临床经验。获2021第五届人民名医盛典(原国之名医盛典)“人民名医·优秀风范”荣誉称号。
先后入选上海市“青年科技启明星”、上海市卫健委“新百人”人才培养计划。曾获国家自然科学基金,上海市科技发展基金资助课题4项。以第一或通讯作者发表SCI论文30余篇、国内核心期刊发表论文30余篇。曾获得全军医疗成果三等奖和全军医疗成果二等奖各一项。
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